博士生部（Collegio dei Docenti）具有最高级别的博士学位授予权，而且在世界上的得到了广泛认可。学术能力通过科研成果和博士论文来评判。

锡耶纳大学的博士学位课程在世界上生物材料领域首屈一指，其开设目的在于保持和提高博士研究和论文的牙科知识水平。博士学位课程的学习与学位授予过程如下：

（1）初级课程学习
按规定，要学习博士学位可称必须首先具备必要的牙科知识。换言之，就是取得欧洲博士学位或同等学位是学习此博士课程的必要条件。

如果考生由海外教育经历，必须首先确定该生所获学位是否符合牙科博士课程的入学条件。如果符合，该生方可入学。

（2）论文导师
博士生部位学生指派研究辅助人员，尤其是指导论文。从学期开始就已经指定每个课程和每位学生的导师。导师都是从各学科的专家教授中选出。

有可能每组有两个导师，虽有分工但都指导论文。如果一个组里有一名外籍导师则不另加派本国导师。如果需要的话，也会安排助理导师来辅助导师工作。

（3）入学
博士学位的入学考试每年举行一次，考试是按照意大利法律和锡耶纳大学的有关规定组织进行的。

按意大利教育系统的规定，通过入学考试的学生允进修意大利最高学位（相当于安格鲁-撒克逊博士学位）。学制三年，论文答辩合格后颁发博士学位证书。论文的写作和答辩均要求用英文完成。

（4）科学学士学位(Master Scientifico Culturale-MSC)
第一年学生需通过四至五门专业课程考试和硕士论文写作与答辩已取得硕士学位。要求论文必须是在同期评论性期刊上发表的。

（5）博士论文
博士论文作为评判独立学术研究能力的依据。有关定详见附录。
要求论文必须用英文完成，并附意大利语、法语和德语摘要各一份。

（6）博士委员会
导师评定成绩后，博士委员会主席应向博士生部提交论文意见。论文意见至少应在导师通知初稿合格后提交。
论文答辩在第三学年进行。
博士委员会的有关要求以锡耶纳大学的博士生管理规定为准。

（7）博士论文审查
对于初稿合格的论文，导师应向博士委员会各成员提交论文副本。
受到论文副本六周后决定是否允许学生答辩。

（8）论文答辩
研究生委员会按锡耶纳大学有关规定组织学生答辩。
研究生委员会具有双重任务：决定学生能否参加答辩；根据答辩情况决定学生能否取得博士学位。
委员会主席可以指定几位教授作为答辩的客座教授。
（9）附录
博士学位学生必须在同期评论性期刊上提交国和发表过至少四篇学术文章。
要求所发表的文章必须是原创作品，而且每篇文章作为毕业论文的独立章节。